Грамматические основы 

Союзы 

Придаточные части выделены разными цветами

Все меня любили (,) и (,) хотя я безмерно шалил (,) мне прощалось всё (,) что бы я ни сделал.

В предложении 4 грамматические основы: «все любили»; «я шалил»; «прощалось всё»; «я (ни) сделал (бы)».

Запятая в цифре 1 разделяет грамматические основы  «все любили»,  «прощалось всё», соединённые союзом  «И» (сложносочинённое предложение).

На  стыке союзов «И», «ХОТЯ» (в цифре 2) запятая ставится, так как дальше есть свободное предложение (без союзов), в которое можно перенести первый союз из пары – «И» («и мне прощалось всё»).

Запятые в цифрах 2 и 3 обособляют придаточную часть с союзом «ХОТЯ»: прощалось (вопреки чему?), хотя я безмерно шалил.

В цифре 4 запятая выделяет придаточную часть с союзным словом «ЧТО»: «прощалось всё» (что именно?), «что бы я ни сделал».